على الرغم من أن كلاً من MOCs وMOFs تحتوي على روابط تنسيق عضوية معدنية-، إلا أن هناك اختلافات جوهرية:
الأبعاد: MOCs عبارة عن جزيئات منفصلة ذات أبعاد صفرية، في حين أن MOFs عبارة عن شبكات ثنائية أو ثلاثية الأبعاد ممتدة بلا حدود.
الذوبانية: معظم MOCs قابلة للذوبان، في حين أن الأطر العضوية المعدنية غير قابلة للذوبان بشكل عام.
الاستقرار: تتمتع الأطر العضوية المعدنية عمومًا بثبات حراري أعلى.
التركيز على التطبيق: تتفوق MOCs في التعرف على الجزيئات، في حين أن الأطر العضوية المعدنية أكثر ملاءمة لتخزين الغاز.